تونل های انجماد دارای ساختاری مشابه با سردخانه های عادی می باشند با این تفاوت که ضخامت دیواره های عایق آن ها 15 و یا 20 سانتی متر است و درب آن ها نیز دارای ضخامتی برابر 15 سانتی متر می باشد. همچنین درب تونل های انجماد مجهز به المنت¬هایی جهت برفک زدایی می باشد. از دیگر تفاوت ها می توان به متفاوت بودن سیستم اواپراتورها اشاره نمود. در تونل های انجماد اواپراتورها بصورت دیواری یا زمینی بوده و دارای راندمان بالا و پرتاب باد زیاد است که این امر موجب می شود تا انجماد مواد غذایی (در دمای 40- درجه سانتی¬گراد) بمدت 8 ساعت، انجام شود. همچنین اواپراتورهای تونل انجماد با ردیف های 10 یا 12 فین در اینچ تولید می شوند. وجه تمایز دیگر تونل های انجماد با سردخانه ها در کمپرسورهای آن ها بوده، بگونه ای که کمپرسورهای تونل های انجماد بصورت دو مرحله ای (Two stage) می باشند.